- 五四红旗团委标兵（2007）—中科院团委2007.01.05
- 第十七届中国十大杰出青年—孙凝晖2006.12.11
- 2006年度中国科学院五四红旗团委称号—自动化所团委2006.11.27
- 2006年度中国科学院五四红旗团委—化学所团委2006.11.27
- 2005年度中国科学院五四红旗团委—生物物理所团委2006.05.12
- 最佳科普宣传奖（2004）—微电子所尚长宏2004.11.27
- 中国科学院五四红旗团委创建单位（2004）—沈阳生态所团委2004.02.27
- 华南植物所获“中科院五四红旗团委创建单位”称号（2003）2003.09.18